上海药物代谢组学研究

LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究案例，中文标题：***通络***通过***和抗氧化作用预防及延缓糖尿病视网膜病变发展的机制研究研究对象：大鼠发表期刊：Biomedicine&Pharmacotherapy影响因子：6.529发表时间：2022年2月合作单位：中国中医科学院广安门医院运用生物技术：LC-MS+GC-MS双平台代谢组学（由鹿明生物提供技术支持)。文章通过对中药***—***通络方改善糖尿病病理方面的深入研究，表明在预防及***方面和微观层面均起到了***效果。同时，也探究出***通络方的内在作用机制。也为糖尿病视网膜病变的早期***，提供***、有效的***方法。其中LC-MS+GC-MS双平台代谢组学有助于对中药成分进行***的分析，为药物机制提供参考。代谢组学 寻找代谢物与生理病理的研究方式。上海药物代谢组学研究

非靶代谢组学研究：2022年03月,欧易/鹿明生物合作客户重庆医科大学附属第二医院消化内科周智航团队在International Journal of Biological Sciences期刊发表的题为 “Enhanced pentose phosphate pathway activity promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression via activating YAP/MMP1 axis under chronic acidosis”的研究成果，通过采用非靶代谢组学和基因表达芯片，发现了适应酸性微环境的胰腺导管腺* (PDAC)细胞具有更强的转移和增殖能力。

代谢组学显示适应酸性微环境的 PDAC 细胞中葡萄糖增加、糖酵解减少，而转录组学发现适应酸性微环境细胞中的差异表达基因主要为细胞外基质修饰和 Hippo 信号传导相关基因。MMP1 在在适应酸性微环境细胞中上调**为明显，实验验证了其由 YAP/TAZ 通路介导，而被 AMPK抑制。该研究确认了代谢重编程通过AMPK/ YAP /MMP1轴促进适应酸性微环境的 PDAC 细胞的增殖和转移。 上海药物代谢组学研究代谢组学-对生物体内所有代谢物进行定量分析。

GC-MS非靶向代谢组学研究，2022年2月，上海市农业科学院食用菌研究所鲍大鹏研究员课题组在《Frontiers in Microbiology》期刊发表的题为“Oxidative Stress and Autophagy Are Important Processes in Post Ripeness and Brown Film Formation in Mycelium of Lentinula edodes”的研究成果，通过iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学等技术对香菇菌丝进行定量蛋白质组学和代谢组学分析，发现氧化应激和自噬是香菇菌丝后熟转色重要过程，并对其在蛋白质组和代谢组水平上的分子机制有了新的认识。中文标题：氧化应激和自噬是香菇菌丝后熟转色形成的重要过程发表期刊：FrontiersinMicrobiology影响因子：5.64作者单位：上海市农业科学院食用菌研究所涉及的欧易/鹿明生物服务产品：iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学。

GC-MS非靶向代谢组：随着纳米材料的产业化,各种形式的纳米材料将以不同途径进入人们的生活,纳米材料的生物安全性问题正受到世界各国科学家的***关注，本篇为2020年2月，南京大学环境学院课题组在Environmental Science & Technology杂志（IF=9.028）发表题为“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究论文。该研究运用16S rRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组技术对土壤微生物组和代谢组学分析技术的独特结合，提供了对AgNPs生态影响的全新视角，***了解了AgNPs暴露对土壤微生物的影响。标题：银纳米颗粒改变种植和未种植黄瓜土壤中的微生物群落组成和代谢物谱期刊：EnvironmentalScience&Technology影响因子：9.028发表时间：2020年2月合作单位：南京大学环境学院运用生物技术：16SrRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组（由鹿明生物提供技术支持）。代谢组学 研究一站式服务平台。

粪便LC-MS代谢组学研究方法，2022年，复旦大学上海市第五人民医院创伤急危重症医学科唐建国教授课题组在FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology期刊发表的题为“DiallylDisulfide(DADS)AmelioratesIntestinalCandidaalbicansInfectionbyModulatingtheGutmicrobiotaandMetabolitesandProvidingIntestinalProtectioninMice”的研究成果，通过粪便微生物16SrRNA测序和粪便LC-MS代谢组学研究方法，发现了DADS***减轻了DSS诱导下肠道白色念珠菌***，并改变了小鼠肠道微生物群落结构和代谢特征，探究了DADS可以调节肠道微生物群和代谢物并保护肠道屏障的内在机理，为***白色念珠菌***提供了理论依据。代谢组学——寻找代谢物与生理病理变化的相对关系研究方式。上海药物代谢组学研究

代谢组学研究技术与应用、代谢组学数据库。上海药物代谢组学研究

本研究通过LC-MS和GC-MS双平台代谢组学研究方法，对92例样品5个时间点的尿液样品进行分析，分别找到了33种和155种与PM和生物气溶胶相关的差异标志物，结果揭示了年轻健康人在五个不同时间点的尿液代谢谱的动态变化，采用KEGG通路富集分析和时间序列分析确定了与短期共同暴露于空气中PM和生物气溶胶相关的几种潜在代谢物生物标志物，发现短期高浓度暴露于PM可能会导致代谢改变并降低应激***水平，这可能是与下丘脑-垂体-肾上腺和交感-肾上腺-髓质轴的***有关；而生物气溶胶剂则通过***系统对病理性成瘾有重要作用。其中尿液中的16-脱氢孕酮可能是PM暴露的潜在生物标志物；4-羟基苯乙醇可能是生物气溶胶的潜在生物标志物，可用于分别预测或诊断PM或生物气溶胶相关疾病。上海药物代谢组学研究

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